196 papers
Deze genomische associatiestudie identificeerde specifieke genetische varianten die onafhankelijk van de COPD-diagnose bijdragen aan variatie in extrapulmonaire kenmerken zoals functionele capaciteit, spierkracht en ziektebelasting, wat de biologische basis voor de heterogeniteit van de ziekte verduidelijkt.
Dit artikel beschrijft de opzet van het AMBER-onderzoek binnen de Generation Scotland-cohort, waarbij via een vragenlijst aan 1.180 deelnemers met een antidepressivagebruiksgeschiedenis gedetailleerde data zijn verzameld om biologische mechanismen achter de variatie in antidepressiva-respons te onderzoeken en toekomstige proefpersonen te selecteren voor verdere biologische analyses.
Dit onderzoek gebruikt verzadigingsgenoomediting om bijna alle BARD1-varianten te testen, waardoor 95,4% van de onzekere genetische varianten kan worden opgelost en het verband tussen BARD1-functieverlies en een verhoogd risico op borstkanker wordt bevestigd.
Deze studie beschrijft een nieuwe, ernstige vorm van ontwikkelings- en epileptische encefalopathie veroorzaakt door bialele RNU2-2-varianten, waarbij diepgaande fenotypering en transcriptoomanalyse van fibroblasten de pathogeniteit bevestigen en een specifieke RNA-sequencing-methode voor toekomstige validatie voorstellen.
Dit onderzoek biedt de eerste uitgebreide catalogus van structurele variaties in populaties uit het Midden-Oosten en Noord-Afrika, waarbij lang-lezen nanopore-sequencing werd gebruikt om duizenden tot nu toe onbekende, populatie-specifieke varianten te identificeren die de klinische interpretatie van genetische aandoeningen bij deze groepen aanzienlijk verbeteren.
Deze studie bevestigt dat een op 67 SNP's gebaseerde genetische risicoscore voor type 1-diabetes een waardevol diagnostisch hulpmiddel is voor Indiase populaties, maar benadrukt dat de prestaties variëren afhankelijk van auto-antilichaamstatus en leeftijd bij aanvang, waardoor het gebruik van op de afkomst afgestemde drempelwaarden noodzakelijk is om de onderclassificatie van risico's die voortvloeit uit Europese normen te voorkomen.
Deze studie toont aan dat RNA-sequencing, wanneer het wordt geïntegreerd met DNA-sequencing, de moleculaire diagnose van mitochondriale ziekten aanzienlijk verbetert door cryptische pathogene varianten, zoals afwijkende splicing en NMD-ontsnapping, bloot te leggen die door DNA-analyse alleen onopgemerkt blijven.
Deze prospectieve case-control studie toont aan dat hoog-resolutie Next-Generation Sequencing van HLA-varianten bij Turkse patiënten met obstructieve slaapapneu specifieke predisponerende (zoals HLA-A*02:01 en HLA-DRB1*04:05) en beschermende (zoals HLA-A*03:01 en HLA-B*35:02) allelen identificeert, wat bijdraagt aan het begrip van de immunogenetische basis van de aandoening.
Deze studie suggereert dat varianten in het HSP90AA1-gen een mogelijke oorzaak zijn van autosomaal dominante mannelijke onvruchtbaarheid bij mensen, hoewel de bevindingen nog verdere bevestiging in onafhankelijke cohorten vereisen.
Deze studie toont aan dat exoomsequencing bij Chileense patiënten met zeldzame aandoeningen een diagnostische opbrengst van 34,3% heeft, waarbij de aanwezigheid van neuroontwikkelingsstoornissen en/of aangeboren afwijkingen de kans op een diagnose vergroot, terwijl eerdere genpanel-testen deze verkleinen en afkomst geen invloed heeft.
Deze studie introduceert EDGAR, een deep learning-framework dat de levenslange ziektebelasting uit elektronische gezondheidsdossiers herleidt om genetische verwarring te detecteren en te elimineren, waardoor de specificiteit van genomische associatiestudies aanzienlijk wordt verbeterd.
Deze studie introduceert COXMM, een nieuw Cox-proportioneel-hazard-mengmodel dat de erfelijkheid van tijd-tot-evenement-traits nauwkeurig schat en inzicht biedt in de genetische architectuur van longitudinale ziekteverloop, waarbij blijkt dat de progressie naar ernstige aandoeningen vaak een lagere erfelijkheid heeft dan de algemene incidentie.
Deze multi-weefsel transcriptoom-wide associatiestudie (TWAS) identificeert 29 risicogenen voor ADHD, waaronder zes nieuwe kandidaten, en biedt zo nieuwe inzichten in de genetische architectuur van de stoornis en potentiële doelen voor medicijnontwikkeling.
Dit artikel introduceert de Human Genotype-Phenotype Map (GPMap), een open-source repository die meer dan 49 miljoen pleiotrope associaties tussen genetische varianten en complexe eigenschappen in kaart brengt om ziektemechanismen te ontrafelen, causale inferentie te verbeteren en de succeskans van medicijntests te voorspellen.
Dit onderzoek toont aan dat het toepassen van niet-additieve genetische modellen (recessief en dominant) in een GWAS bij idiopathische pulmonale fibrose vijf nieuwe signaalloci identificeerde, waaronder PMF1 en EPN3, wat nieuwe inzichten biedt in de pathogenese van de ziekte.
Deze studie identificeert gedeelde genetische mechanismen voor fibrose over twaalf orgaansystemen heen, waardoor nieuwe therapeutische doelen worden onthuld.
Dit onderzoek toont aan dat redenerende grote taalmodellen de automatische extractie van klinisch genetisch bewijs (PS4) uit literatuur met hoge nauwkeurigheid kunnen ondersteunen, hoewel prestaties model- en promptafhankelijk zijn en fouten vaak voortkomen uit het incorrect toepassen van richtlijnen, wat een hybride workflow met menselijke escalatie vereist.
Deze studie analyseerde de zelfgerapporteerde gezondheidsgegevens van 70.724 personen met hoge-resolutie HLA-genotypering om dertien nieuwe associaties te ontdekken, waaronder een sterke link tussen HLA-DRB1*04:01 en allergie voor het antibioticum cefaclor, wat aantoont dat het combineren van grootschalige genotypen met niet-EHR-gebaseerde fenotypen waardevolle inzichten biedt in immunogenetica en farmacogenetica.
In deze genomewide associatiestudie met bijna 700.000 personen werden 80 genetische varianten geïdentificeerd die geassocieerd zijn met de ernst van gegeneraliseerde angstsymptomen, waarbij 39 nieuwe loci werden gevonden en sterke genetische correlaties werden aangetoond met andere mentale en fysieke gezondheidsproblemen.
Een Phenome-wide Mendeliaanse Randomisatie-studie toont aan dat GLP1R-expressie beschermend werkt tegen 58 ziekten maar het risico op 34 andere aandoeningen, waaronder neonatale gezondheidsproblemen en vitamine D-tekort, verhoogt, terwijl CETP-remming slechts een beperkt cardioprotectief effect heeft.